Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SYCP1Q15431 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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