Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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