Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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