Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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