Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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