Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
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