Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms