Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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