Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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