Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms