Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GDE1Q9NZC3 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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