Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD1Q9GZZ0 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms