Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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FOXQ1Q9C009 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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