Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRERF1Q96PN7 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRERF1Q96PN7 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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