Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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CCDC47Q96A33 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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CCDC47Q96A33 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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CCDC47Q96A33 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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