Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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