Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
IMPG1Q17R60 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms