Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPROQ16827 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPROQ16827 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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