Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ZNF239Q16600 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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