Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
E2F4Q16254 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms