Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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