Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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