Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHHQ15465 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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