Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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