Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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COL19A1Q14993 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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