Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PKP1Q13835 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PKP1Q13835 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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