Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGA9Q13797 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms