Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms