Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SP140Q13342 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SP140Q13342 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SP140Q13342 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
SP140Q13342 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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