Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRSQ13332 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRSQ13332 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms