Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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RPA4Q13156 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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RPA4Q13156 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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