Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CALCOCO2Q13137 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CALCOCO2Q13137 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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