Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
STX4Q12846 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
STX4Q12846 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms