Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms