Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNX13Q9Y5W8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNX13Q9Y5W8 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNX13Q9Y5W8 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SNX13Q9Y5W8 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SNX13Q9Y5W8 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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