Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ANKRD42Q8N9B4 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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