Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HAPLN4Q86UW8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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