Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC142Q17RM4 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms