Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PCK2Q16822 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PCK2Q16822 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PCK2Q16822 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PCK2Q16822 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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