Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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