Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PCSK7Q16549 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms