Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNXAQ16473 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms