Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms