Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms