Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATP6AP1Q15904 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms