Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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SCN9AQ15858 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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