Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
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NEDD8Q15843 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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NEDD8Q15843 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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NEDD8Q15843 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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NEDD8Q15843 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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NEDD8Q15843 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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