Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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