Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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