Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms